中國(guó)科學(xué)院合肥物質(zhì)科學(xué)研究院（簡(jiǎn)稱(chēng)合肥研究院）是中國(guó)科學(xué)院所屬最大的綜合性科研機(jī)構(gòu)之一，位于合肥市蜀山區(qū)科學(xué)島，面積2.65平方公里。由安光所、等離子體所、固體所、智能所、強(qiáng)磁場(chǎng)中心、核能安全所、健康所7個(gè)研究單元組成。與地方政府共建了6個(gè)成果轉(zhuǎn)化平臺(tái)。現(xiàn)有職工約2700名，領(lǐng)軍人才如兩院院士、海內(nèi)外高層次人才、國(guó)家杰出青年基金獲得者、國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃首席科學(xué)家、關(guān)鍵技術(shù)人才等300余人。設(shè)有5個(gè)博士后流動(dòng)站、18個(gè)博士點(diǎn)和20個(gè)碩士點(diǎn)，在學(xué)研究生約2500名。擁有30多個(gè)國(guó)家或省部級(jí)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和研究中心，以及10多個(gè)大型實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。
合肥研究院的科研方向包括等離子體物理、磁約束核聚變工程、大氣環(huán)境光學(xué)遙感、激光與光電子科學(xué)技術(shù)、強(qiáng)磁場(chǎng)科學(xué)與技術(shù)、環(huán)境科學(xué)與工程、先進(jìn)核能、生物物理、轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)、先進(jìn)診療技術(shù)、材料科學(xué)與工程、人工智能與機(jī)器人、智慧農(nóng)業(yè)技術(shù)等，并取得了諸多重大科研成果。
作為科研實(shí)力雄厚的大型綜合性科研基地，合肥研究院是國(guó)家創(chuàng)新人才培養(yǎng)示范基地、國(guó)家示范型國(guó)際科技合作基地、國(guó)家雙創(chuàng)示范基地等。已經(jīng)建成并運(yùn)行了兩個(gè)國(guó)家大科學(xué)裝置，分別為：全超導(dǎo)托卡馬克核聚變實(shí)驗(yàn)裝置、穩(wěn)態(tài)強(qiáng)磁場(chǎng)實(shí)驗(yàn)裝置，正在建設(shè)第三個(gè)大科學(xué)裝置—聚變堆主機(jī)關(guān)鍵系統(tǒng)綜合研究設(shè)施。此外，大氣環(huán)境立體探測(cè)設(shè)施、強(qiáng)光磁集成實(shí)驗(yàn)設(shè)施正在開(kāi)展預(yù)研工作。
2014年，合肥研究院和中國(guó)科大聯(lián)合申請(qǐng)成立了“中科院合肥大科學(xué)中心”，該中心于2016年以“優(yōu)秀”成績(jī)完成籌建。在此基礎(chǔ)上，合肥研究院積極推動(dòng)安徽省、中科院聯(lián)合申報(bào)合肥綜合性國(guó)家科學(xué)中心,并于2017年正式獲批，由安徽省人民政府和中國(guó)科學(xué)院共建，合肥研究院是合肥綜合性國(guó)家科學(xué)中心的核心建設(shè)單位之一。