中國科學院上海有機化學研究所（簡稱上海有機所）是集基礎研究、應用研究和高技術(shù)創(chuàng)新研究為一體的綜合性化學研究機構(gòu)，創(chuàng)建于1950年5月，是中國科學院首批成立的15個研究所之一，前身是建立于1928年7月的前中央研究院化學研究所。從開展抗生素和高分子化學的研究起步，經(jīng)過70年幾代人艱苦創(chuàng)業(yè)、奮力拼搏，在以有機化學研究為中心的基礎研究、應用研究與高新技術(shù)開發(fā)、人才培養(yǎng)等方面均取得令人矚目的成就。在我國“兩彈一星”研制、“人工合成牛胰島素、人工合成酵母丙氨酸轉(zhuǎn)移核糖核酸”和“物理有機化學中的兩個基本問題：自由基化學中取代基離域參數(shù)和有機分子簇集概念”等一批攀登科技高峰的重要成果中，我所科研人員作出了重要貢獻。
根據(jù)中科院新時期“三個面向，四個率先”辦院方針要求，上海有機所戰(zhàn)略定位為：立足基礎交叉前沿領域，堅持重大科學問題和國家重大需求導向，發(fā)揮有機合成化學的創(chuàng)造性，加強與生命科學、材料科學的交叉與融合；致力于推動我國化學轉(zhuǎn)化方法學、化學生物學、有機新材料創(chuàng)制科學等重點學科領域的發(fā)展；在有機化學基礎研究、新醫(yī)藥農(nóng)藥和高性能有機材料創(chuàng)制方面實現(xiàn)新的突破；引領有機化學學科前沿的發(fā)展，滿足國家戰(zhàn)略需求，服務國民經(jīng)濟主戰(zhàn)場；將上海有機所建設成為國際一流的有機化學研究中心。
在此定位下，上海有機所努力實現(xiàn)三個方面的重大突破，即高性能聚烯烴材料制備的關鍵科學、技術(shù)與應用；化學理念指導的菌種改造和微生態(tài)系統(tǒng)構(gòu)建的集成性研究與應用；高性能有機氟材料的關鍵科學、技術(shù)與應用。在實現(xiàn)三個方面的重大突破的同時，重點培育五個學科發(fā)展方向與發(fā)展領域：導向綠色合成的新一代催化轉(zhuǎn)化；導向藥物發(fā)現(xiàn)的復雜天然產(chǎn)物全合成和系統(tǒng)化學生物學研究；重要醫(yī)藥、農(nóng)藥的核心制備科學、技術(shù)與應用；高性能有機功能材料的結(jié)構(gòu)設計、合成與應用；含能及推進劑關鍵材料的研究與開發(fā)。
上海有機所現(xiàn)有2個國家重點實驗室、4個院重點實驗室，分別為：生命有機化學國家重點實驗室、金屬有機化學國家重點實驗室、中國科學院有機氟化學重點實驗室、中國科學院天然產(chǎn)物有機合成化學重點實驗室、中國科學院有機功能分子合成與組裝化學重點實驗室和中國科學院能量調(diào)控材料重點實驗室。此外，還有同國內(nèi)外大學、企業(yè)聯(lián)合共建的，如滬港化學合成聯(lián)合實驗室、寧波新材料創(chuàng)制中心等多個聯(lián)合研究中心。
截止2020年底，上海有機所共獲得各種科研成果獎363項，包括國家三大獎75項，其中國家自然科學一等獎3項（其中2項為合作）、二等獎20項（其中1項為合作）；國家創(chuàng)造發(fā)明獎3項和國家發(fā)明二等獎4項（其中3項為合作）；國家科技進步獎特等獎3項（合作），一等獎1項（合作），二等獎12項（其中6項為合作）；獲得包括中國科學院自然科學一等獎28項在內(nèi)的中國科學院各類獎145項；上海市科技成果獎92項。共獲授權(quán)專利1028項（其中國外專利49項），發(fā)表學術(shù)論文12319余篇。共有在職職工695人。包括中國科學院院士8人、研究員及正高級工程技術(shù)人員93人、副研究員及高級技術(shù)人員193人。在學研究生672人。在站博士后60人。
受中國化學會委托，上海有機所負責編輯出版《有機化學》、《化學學報》和《中國化學》（英文版）。
負責研究生教育規(guī)劃的制定與實施；負責學科點增列與撤銷、學科評估等學科建設工作；負責研究生指導教師隊伍建設與管理工作；負責研究生培養(yǎng)質(zhì)量自我評估和社會評估、相關培養(yǎng)制度的制定與完善、相關措施的推進與落實等研究生培養(yǎng)質(zhì)量保證舉措；負責招生、培養(yǎng)、學位、學籍、就業(yè)指導、畢業(yè)派遣等研究生日常管理工作；負責攻讀學位留學生的招收與培養(yǎng)工作；負責與高校聯(lián)培工作規(guī)范管理與制度完善、大學生暑期夏令營、大學生暑期實踐和科創(chuàng)計劃等科教融合工作；協(xié)助中國科學院生物與化學交叉中心、國科大杭州高等研究院化學與材料學院等做好研究生教育相關工作；負責研究生思政工作、心理健康工作、突發(fā)事件處理；負責指導學生會開展研究生文體比賽、大型晚會、學術(shù)論壇等活動；負責研究生公寓分配與相關管理工作；負責優(yōu)秀博士生發(fā)展獎學金的考核與資助工作；負責歸口對外文字材料、PPT的�？�；所領導交辦的其它工作等。