中國科學院生態(tài)環(huán)境研究中心（簡稱生態(tài)環(huán)境中心）始建于1975年，時為國務院批準成立的中國科學院環(huán)境化學研究所，1986年與中國科學院生態(tài)學研究中心（籌）合并，建立中國科學院生態(tài)環(huán)境研究中心，是我國第一個全國性生態(tài)環(huán)境領域綜合性研究機構。
生態(tài)環(huán)境中心圍繞“國家生態(tài)環(huán)境安全與可持續(xù)發(fā)展”戰(zhàn)略定位，充分發(fā)揮生態(tài)環(huán)境中心環(huán)境科學、環(huán)境工程和生態(tài)學三大學科的綜合優(yōu)勢，圍繞國家環(huán)境保護與生態(tài)建設的重大科技需求和國際生態(tài)環(huán)境科學前沿，不斷突破支撐國家生態(tài)安全、環(huán)境健康和可持續(xù)發(fā)展的重大科學理論與關鍵技術，為我國生態(tài)文明建設、環(huán)境治理與生態(tài)保護、實現人與自然的和諧發(fā)展做出基礎性、戰(zhàn)略性、前瞻性創(chuàng)新貢獻，努力成為我國生態(tài)環(huán)境科學應用基礎研究和技術創(chuàng)新基地、高級專門人才培養(yǎng)基地，國內領先、國際一流的生態(tài)環(huán)境綜合性研究機構。
生態(tài)環(huán)境中心主要學科方向為：持久性有毒污染物的環(huán)境過程與控制、環(huán)境污染的健康風險、污染水體修復與飲用水安全保障技術、人與自然耦合機制、城市與區(qū)域可持續(xù)發(fā)展理論與對策、環(huán)境生物技術的理論與應用。力爭在環(huán)境污染的健康效應與危害機制、飲用水復合污染機理、過程與控制、生態(tài)系統(tǒng)服務形成機理和生態(tài)效益評估等三個領域取得重大突破；重點培養(yǎng)新型污染物的識別及毒性效應、京津冀環(huán)境多介質復合污染協(xié)同削減與調控、城市化的生態(tài)環(huán)境效應與生態(tài)管理、大氣污染成因與關鍵污染物控制技術、環(huán)境納米材料與污染控制、污染物定向生物轉化、固體廢棄物資源化利用技術等方向。
生態(tài)環(huán)境中心現有3個國家重點實驗室、1個國家工程實驗室、2個中國科學院重點實驗室、5個所級實驗室及若干支撐服務系統(tǒng)平臺。國家重點實驗室包括環(huán)境化學與生態(tài)毒理學國家重點實驗室、環(huán)境水質學國家重點實驗室（環(huán)境模擬與污染控制國家重點聯(lián)合實驗室）、城市與區(qū)域生態(tài)國家重點實驗室；中國科學院重點實驗室包括中國科學院環(huán)境生物技術重點實驗室、中國科學院飲用水科學與技術重點實驗室；所級實驗室包括：生態(tài)環(huán)境中心大氣環(huán)境與污染控制實驗室、水污染控制實驗室、土壤環(huán)境科學與技術實驗室、環(huán)境納米技術與健康效應重點實驗室、固體廢棄物處理與資源化實驗室；支撐服務系統(tǒng)平臺包括：文獻信息與學術傳播中心（下設8個期刊編輯部）、大型分析儀器實驗室、二惡英實驗室、水質分析實驗室和北京城市生態(tài)系統(tǒng)研究站。其中二惡英實驗室為實驗室認可和計量認證實驗室、水質分析實驗室為計量認證實驗室。生態(tài)環(huán)境中心是農業(yè)部批準的農藥登記殘留試驗認證單位之一。
截至2020年底，生態(tài)環(huán)境中心共有在職職工501人，包括中國科學院院士3人、中國工程院院士3人、發(fā)展中國家科學院院士4人，研究員及正高級工程技術人員121人、副研究員及高級工程技術人員128人，國家杰出青年科學基金獲得者22人，優(yōu)秀青年科學基金獲得者26人。
生態(tài)環(huán)境中心組建有“持久性有毒污染物形態(tài)、環(huán)境過程與毒理效應”、“環(huán)境微界面過程與污染控制”、“土地利用與生態(tài)過程”、“持久性有毒污染物的環(huán)境過程與毒理效應”和“環(huán)境污染與健康危害”等5個國家基金委創(chuàng)新研究群體和“持久性有毒化學污染物”、“生態(tài)系統(tǒng)過程與服務”、“飲用水安全”等3個中國科學院創(chuàng)新研究團隊。
生態(tài)環(huán)境中心是國務院學位委員會批準的碩士學位（1980年）、博士學位（1986年）授予權單位之一，擁有環(huán)境科學、環(huán)境工程、生態(tài)學、環(huán)境經濟與環(huán)境管理、分析化學、有機化學等博士學科培養(yǎng)點，環(huán)境科學、環(huán)境工程、生態(tài)學、環(huán)境經濟與環(huán)境管理、分析化學、有機化學等碩士學科培養(yǎng)點，設有環(huán)境科學與工程、生物學、生態(tài)學博士后流動站。中國科學院博士研究生教育重點培養(yǎng)基地，“環(huán)境科學與工程”流動站為全國優(yōu)秀博士后流動站。截止2020年底，共有在學研究生887人，其中碩士生337人、博士生550人；在站博士后226人。
生態(tài)環(huán)境中心積極推進與政府有關部門、高校和企業(yè)的合作，大力實施國際化發(fā)展戰(zhàn)略。在開展科技合作的基礎上，努力為解決地區(qū)性生態(tài)環(huán)境問題服務，不斷提高生態(tài)環(huán)境中心為地方經濟建設、環(huán)境治理、生態(tài)建設和可持續(xù)發(fā)展提供科學技術支撐的能力。生態(tài)環(huán)境中心分別與美國、德國、日本、英國、加拿大、瑞士、瑞典、荷蘭和澳大利亞等國的有關大學和研究所建立了良好的科研合作關系，共建聯(lián)合研究所和實驗室，進行學術交流和聯(lián)合培養(yǎng)研究生。生態(tài)環(huán)境中心科研人員多人次在國際組織、專業(yè)委員會和國際期刊中任職，在相關的國際組織活動中發(fā)揮了重要作用，提高了我國科學家在國際生態(tài)環(huán)境科學等領域的科學地位。依托生態(tài)環(huán)境中心建設有聯(lián)合國環(huán)境規(guī)劃署持久性有機污染物分析示范實驗室、住房和城鄉(xiāng)建設部農村污水處理技術北方研究中心。生態(tài)環(huán)境中心與南澳大利亞水務公司共建國際水科學技術中心、與挪威共建中-挪環(huán)境綜合研究中心、與橫濱國立大學聯(lián)合共建亞洲國際生態(tài)環(huán)境安全管理中國聯(lián)合研究中心、與中國節(jié)能投資公司共建中環(huán)水務-生態(tài)環(huán)境中心聯(lián)合研發(fā)基地、與鹽城共建先進環(huán)保技術研究院、與石家莊循環(huán)化工園區(qū)管委會共建石家莊環(huán)保技術研究院等。
建所以來，生態(tài)環(huán)境中心先后承擔并完成了大量國家、中國科學院、省部級研究項目以及國際合作項目，共獲得國家和省部級成果獎勵335項，其中國家級獎勵50項（以第一單位完成獲得24項）；發(fā)表SCI、EI第一著者論文數連續(xù)10多年在中國科學院資源環(huán)境類研究所位列第一。生態(tài)環(huán)境中心在本領域成果豐碩，不僅在知識積累、方法儲備和人才隊伍等方面為生態(tài)環(huán)境領域的綜合研究奠定了堅實基礎，而且為制定我國新時期生態(tài)環(huán)境保護與管理政策提供了科學依據，為國家生態(tài)安全保障提供了重要科技支撐。形成了包括環(huán)境科學、環(huán)境工程、生態(tài)學、分析化學、有機化學、環(huán)境經濟與環(huán)境管理專業(yè)等多學科體系，在新POPs發(fā)現和分析方法、分子毒理及其表觀遺傳學、二惡英控制、生態(tài)系統(tǒng)服務、城市與景觀生態(tài)、飲用水安全控制等方面取得了高水平和原創(chuàng)性的研究成果；目前已形成了一支創(chuàng)新能力強的高水平研究隊伍，初步建成了世界一流的生態(tài)環(huán)境科學研究平臺。
生態(tài)環(huán)境中心1999年首批進入中國科學院知識創(chuàng)新工程試點。2010年，在知識創(chuàng)新工程綜合評估中，生態(tài)環(huán)境中心獲資環(huán)領域并列第一，研究所綜合評估A，被評為中國科學院A類研究所。2011年第一批進入中國科學院“創(chuàng)新2020”和“一三五”發(fā)展規(guī)劃擇優(yōu)支持研究所。2015年，中國科學院批準依托生態(tài)環(huán)境中心建設中國科學院生態(tài)環(huán)境科學科教融合卓越中心。2016年，國家發(fā)展和改革委員會批準依托生態(tài)環(huán)境中心建設高濃度難降解有機廢水處理技術國家工程實驗室。2021年，“工業(yè)廢水無害化與資源化國家工程研究中心”納入國家發(fā)展和改革委員會第一批新序列國家工程研究中心名單。
生態(tài)環(huán)境中心是中國生態(tài)學學會、國際環(huán)境問題科學委員會中國委員會的掛靠單位。負責編輯出版Journal of Environmental Sciences（SCI和EI收錄）、《生態(tài)學報》、《環(huán)境科學》、《環(huán)境科學學報》、《環(huán)境工程學報》、《環(huán)境化學》、《生態(tài)毒理學報》和Ecosystem Health and Sustainability（SCIE收錄）等8種自然科學學術期刊，國際刊物Environmental Science & Technology Asian office、國際水協(xié)會IWA Beijing office、國際環(huán)境問題科學委員會SCOPE Beijing office設在生態(tài)環(huán)境中心。生態(tài)環(huán)境中心科學家分別在國際地理聯(lián)合會、太平洋科學協(xié)會、國際生態(tài)學協(xié)會等57個國際重要組織擔任主席、副主席等重要職務30人，在Environmental Science & Technology，Sustainability Science等91個重要國際學術期刊中擔任主編、副主編23人。
中國科學院生態(tài)環(huán)境研究中心擁有環(huán)境科學、環(huán)境工程、生態(tài)學、環(huán)境經濟與環(huán)境管理、分析化學、有機化學等博士學科培養(yǎng)點，環(huán)境科學、環(huán)境工程、生態(tài)學、環(huán)境經濟與環(huán)境管理、分析化學、有機化學等碩士學科培養(yǎng)點，設有環(huán)境科學與工程、生物學、生態(tài)學博士后流動站。1998年被評為中國科學院博士研究生教育重點培養(yǎng)基地。2003年在教育部環(huán)境科學與工程學科評估中名列前茅。
自1978年恢復招收研究生以來，共招收研究生2808名，其中碩士研究生1105名，博士研究生1703名；已授碩士學位640人，授博士學位1168人；目前在讀博士研究生442名，在讀碩士研究生262名，在站博士后148人。自2004年開始招收留學生，目前有來自美國、尼泊爾等留學生9人，另有外籍進修生和外籍博士后數名。通過接收免試推薦的優(yōu)秀本科生、實行碩博連讀、加強對博士學位論文的管理、與國外聯(lián)合培養(yǎng)等措施，為國家培養(yǎng)了一批生態(tài)與環(huán)境科學研究人才，為我國社會經濟的持續(xù)發(fā)展和環(huán)境保護事業(yè)做出了貢獻。
自1990年以來，4名畢業(yè)生榮獲全國“百篇”優(yōu)秀博士學位論文，6名畢業(yè)生獲中科院院長獎學金特別獎，13名畢業(yè)生入選中科院優(yōu)秀博士學位論文，共有282人次獲得中科院院長獎學金和冠名獎等各類獎勵和表彰，更多學長在各自的工作領域內成為了佼佼者，令后輩晚學羨慕不已。