香港能仁專上學院，香港僧伽聯(lián)合會同人鑒于本港人口劇增，高等教育學位奇缺，不能滿足有志青年獲得高深學術的求知欲望，與及社會人心之隳廢，日趨嚴重。 1969 年 4 月，「能仁書院」校名正式向港府申請注冊為不牟利大專及大學預科，并承核準。 大專部當時設有佛學系、中國文史學系、英國語文學系、社會教育學系、工商管理學系、藝術學系等六系。 大學預科分設文、理組，廣開課程，任學生自由選修以應升學就業(yè)需要。
1970年4月為配合本院發(fā)展，斥資港幣60余萬元，購得九龍深水埗醫(yī)局街176-178號樓宇一幢，樓高六層，內(nèi)辟實驗室、圖書室、特別室等設備。 1971-1972 年，本院在荔枝角道 325 號興建七層大樓，由于設備充實，導師由國內(nèi)外著名學者擔任，設立四年制文商各系大學學士學位課程，為各界所重視，國外美、加、日、澳等國大學均予承認學位。
為提倡研究高深學術，又于九龍元洲街 340 號三樓自置校舍，增設哲學研究所，為廣大青年和社會在職人士提供碩士、博士學位課程。 翌年蒙臺北教育部核準。 未幾，復蒙核準增設中國文學研究所。
近年香港學生及其家長對專上學位需求日增，而大學學位嚴重不足，為配合社會的發(fā)展，本會決意將香港能仁書院升格為一所有名望的私立大學。 以博愛及慈悲之精神，教化學子正知正見，獲得正面的人生觀，期望將來學子能以慈悲心、無私的奉獻，回饋社會。
本書院已于2012 年9月開辦三個香港政府認可的副學士課程 （主修工商管理、中文、視覺傳意設計）（資歷級別第四級）。
校方于2013年6月完成由香港學術及職業(yè)資歷評審局審批的院校評審及兩個4年全日制的學士課程（主修中文、會計），待教育局批準后，便可于2014年9 月開辦。
2014年4月，香港能仁專上學院（學院）創(chuàng)校。 前身為由香港佛教僧伽聯(lián)合會出資營辦的私立非牟利教育機構(gòu)--創(chuàng)校于1969年的香港能仁書院（書院）。 由2011年開始，書院積極籌備升格成為「香港能仁專上學院」。 至2014年4月，書院終于獲香港特別行政區(qū)政府批準升格成為「香港能仁專上學院」，獲授權頒授4年全日制大學學位。 學院將于2014年9月正式開辦兩個4年全日制學士學位課程。
學院開辦2個學士學位課程（中文、會計）、4個副學士課程（工商管理、中文、視覺傳意設計、房地產(chǎn)管理）及基礎專上教育文憑課程。 全部課程獲香港學術及職業(yè)資歷評審局批核。
學院開辦2個榮譽學士學位課程（市場營銷及跨文化傳意英文）（資歷級別：5）。 課程經(jīng)香港學術及職業(yè)資歷評審局批核。經(jīng)香港學術及職業(yè)資歷評審局成功覆審，學院繼續(xù)開辦中文副學士及工商管理副學士課程（資歷級別：4）。2015年11月，香港工商學院有限公司正式成為香港能仁專上學院有限公司的新成員。
學院開辦工商管理（榮譽）學士課程（主修：人力資源管理 / 銀行及財經(jīng)事務）（資歷級別：5）。 課程經(jīng)香港學術及職業(yè)資歷評審局批核。經(jīng)香港學術及職業(yè)資歷評審局成功覆審，學院繼續(xù)開辦基礎專上教育文憑課程（資歷級別：3）。學院成為英國西倫敦大學在香港的合作伙伴，在港開辦英國西倫敦大學資歷的課程。
學院成功通過香港學術及職業(yè)資歷評審局的復審，可以繼續(xù)開辦中文（榮譽）文學士課程及會計（榮譽）工商管理學士學位課程（資歷級別：5級），可見其質(zhì)素得到充份肯定。學院亦成功得到行政會議批準，并先后通過香港學術及職業(yè)資歷評審局與社工注冊局的評審，具備開辦社工學士課程的資格，并準備下學年正式開課。
學院正式開辦4年全日制社會工作（榮譽）學士課程（資歷級別：5級），首年錄取超過40名學生，相當接近社工注冊局批出的收生上限，可見學生對學院的認可及期待。學院亦成功通過香港學術及職業(yè)資歷評審局的評審，具備開辦「健康管理及社會關懷」高級文憑課程的資格，替學院將來開辦護理系課程奠下良好基礎。
2020年5月，醫(yī)療及護理學院院長汪國成教授接任為署理校長，繼續(xù)為學院未來發(fā)展作出貢獻。學院正式開辦2年全日制健康管理及社會關懷高級文憑課程（資歷級別：4級），建立由文憑，高級文憑與學士學位組成的升學階梯，為學生提供完善且廣闊的升學與就業(yè)出路。學院是第三間社工課程一年級收生滿額的自資院校，現(xiàn)時正開辦中文，社工，會計，健康管理及社會關懷等學士及文憑課程，以滿足社會及學生對學院的期望及支持。同時，學院正等待香港護士管理局最后審批，較早前更已通過香港學術及職業(yè)資歷評審局的評審，預計下學年能開辦籌備多年的護理學（榮譽）學士學位課程。