北京市心肺血管疾病研究所成立于1981年，由我國已故著名心血管疾病專家吳英愷院士創(chuàng)建，是以心、肺血管相關(guān)疾病防治的應(yīng)用基礎(chǔ)和臨床研究為主要方向的公益性研究所。北京市心肺血管疾病研究所從創(chuàng)建初期就與首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京安貞醫(yī)院，在行政管理和專業(yè)學(xué)科發(fā)展上形成了集科研、臨床和預(yù)防一體化的聯(lián)合體。
研究所辦公室負(fù)責(zé)協(xié)助所領(lǐng)導(dǎo)完成研究所各項(xiàng)行政事務(wù)性工作。研究所目前設(shè)有8個(gè)研究室：心血管生物學(xué)研究室、流行病研究室、高血壓研究室、上氣道功能障礙相關(guān)心血管疾病研究室、動(dòng)脈粥樣硬化研究室、生物醫(yī)學(xué)工程研究室、人群防治研究室、藥理研究室、分子生物與細(xì)胞學(xué)研究室。2個(gè)科研服務(wù)平臺：實(shí)驗(yàn)中心、實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心。4個(gè)專業(yè)雜志編輯部：《心肺血管病雜志》編輯部、《中華胸心血管外科雜志》編輯部、《北京生物醫(yī)學(xué)工程雜志》編輯部及《中國醫(yī)藥》雜志編輯部。